Một trong những nội dung quan trọng của quả trình hội nhập về sở hữu công nghiệp mà Cuc sở hữu công nghiệp đề xuất là xây dựng và hoàn chỉnh hệ thống các văn bane pháp luật về sở hữu công nghiệp, cụ thể là sửa đổi, bổ sung hệ thống các quy phạm pháp luật hiện có để đáp ứng các yêu cầu của TRIPS( HIệp định về các khía cạnh liên quan đến thương mại của quyền sở hữu trí tuệ) để chuẩn bị ra nhập WTO, ban hành các văn bản về việc bảo hộ các đối tượng sở hữu công nghiệp mới, ban hành các văn bản về sử phạt hành chính các vi phạm về quyền sở hữu công nghiệp cũng như các văn bản về xử lý các tranh chấp, vi phạm quyền sở hữu công nghiệp theo thủ tục tố tụng dân sự.

Để thực hiện các nội dung hội nhập về sở hữu trí tuệ nói trên, Cục sở hữu Công Nghiệp đã khẩn trương nghiên cứu, soạn thảo và dề nghị Bộ Khoa hoc, Công nghệ và Môi trường trình Chính phủ lần lượt ban hành các Nghị định sau:

• Nghị định số 12/1999/NĐ-CP ngày 06.3.1999 về sử phạt vi phạm hành chính trong lĩnh vực sở hữu công nghiệp;
• Nghị định số 54/2000/NĐ-CP ngày 03.10.2000 về bảo hộ bí mật kinh doanh, chỉ dẫn địa lý, tên thương mại và quyền chống canh tranh không lành mạnh liên quan tới sở hữu công nghiệp;
• Nghị định số 06/2001/NĐ- CP ngày 01.02.2001 về sửa đổi, bổ sung một số điều khoản của Nghị định 63/CP quy định chi tiết về sở hữu công nghiệp.

Sau mỗi Nghị định của Chính phủ, Cục sở hữu công nghiệp đều chuẩn bị Thông tư hoặc Thông tư liên tịch trình Bộ Khoa hoc, Công nghệ và Môi trường và Bộ nghành có liên quan nhằm giải thích hướng dẫn việc thi hành nghị định đó. Ngoài ra Cục sở hữu công nghiệp còn ban hành những tác nghiệp cụ thể như: QUy định về hình thức và nội dung các laọi đơn về sở hữu công nghiệp, Quy chế xét nghiệm các laọi đơn về sở hữu công nghiệp, Quy chế về công bố thông tin sở hữu công nghiệp.

Cùng với việc xây dựng các văn bản pháp luật Cục Sở hữu công nghiệp tiếp tục triển khai nhiều hoạt động chuyên môn, nghiệp vụ nhằm thực thi các văn bản đó. Cũng giống như giai đoạn trước đó, các hoạt động chủ yếu của Cục là thực hiện các chủ trương xác lập quyền sở hữu công nghiệp, thực thi các chức năng quản lý Nhà nước về sở hữu công nghiệp, đào tạo cán bộ, hợp tác quốc tế và thông tin tư liệu.